Introducción breve: 전쟁의 시대가 끝나면서, 닌자들은 이전처럼 중요하지 않게 되었다. 닌자 학교도 일반 학생들을 모집하기 시작했다. 보루토는 7대 화력의 성역, 나루토의 아들로, 아버지의 발자취를 따라 닌자가 되기로 결심했다. 처음에는 보루토는 평화로운 생활을 즐기며 친구들과 함께 닌자 기술을 연습했다. 그러나 이 평온한 상황은 오래가지 않았다. 신비한 단체가 활동을 시작하고, 그들의 목표는 닌자 세계를 파괴하고 무력 균형을 재구축하는 것이었다. 이렇게 격렬한 적에 마주하면서 아직 닌자 학교에서 공부하고 있던 보루토는 결국 싸움에 참여하기로 결심했다. 생사의 기로에서 보루토의 닌자 기술과 전투력은 빠르게 성장했다. 결국, 동료들의 지원을 받아 보루토는 악의 조직의 리더를 이긴 결과, 평화를 지키는데 성공했다.